Zavod organizira v skladu z normativi in standardi svetovalno službo, ki svetuje učencem in staršem ter sodeluje z učitelji in vodstvom šole pri načrtovanju, spremljanju in evalvaciji razvoja zavoda ter pri opravljanju vzgojno - izobraževalnega dela.
Šola naj ne bo le priprava na življenje, ampak resnična opora mladim v življenju. Temu cilju se skušamo približati tako učitelji, kot šolska svetovalna služba. Izhajajoč iz tega, ugotavljamo stanje, načrtujemo spremembe, iščemo ustrezne poti in načrtujemo konkretne aktivnosti.
Svetovalno službo vodi ga. Marija Pernek .
V letošnjem letu nudi dodatno strokovno pomoč učencem defektologinja ga. Tadeja Lesjak, ki je ob ponedeljkih,sredah,četrtkih in petkih od 7.30 do 9.10 na Ptujski Gori, ostale dni pa je v Majšperku.

Uradne ure šolske svetovalne službe:
matična šola 8.30 - 14.30
enota Ptujska Gora prvi torek v mesecu, po predhodnem dogovoru
enota Stoperce drugi torek v mesecu, po predhodnem dogovoru